L’apparition généralisée de l’ADN de Neandertal : Les Africains l’ont aussi

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On a longtemps soutenu que l’ADN dérivé de l’homme de Néandertal se trouve chez tous les non-Africains. En conséquence, on a supposé que les Africains ne sont pas porteurs d’une ascendance néandertalienne… même si des squelettes de Néandertaliens ont été trouvés en Afrique du Nord à Jebel Ighoud et Haua Fteah.

Le pourcentage d’ascendance néandertalienne chez les Africains

L’idée que les Africains ne sont pas porteurs de l’ADN de Néandertal a récemment été prouvée comme étant fausse. Marc Haber, un généticien britannique du Wellcome Trust Sanger Institute à Hinxton, a découvert que les Toubous au Tchad et les Amhara en Ethiopie sont porteurs de gènes de Néandertal. Alors que les Eurasiens sont porteurs d’environ 2 % d’ancêtres néandertaliens, les Éthiopiens sont porteurs d’environ 1 % d’ancêtres néandertaliens et les Centrafricains sont porteurs d’environ 0,5 % d’ancêtres néandertaliens.

Haber soutient que les Africains qui portent l’ADN de Neandertal montrent un flux de gènes provenant des Eurasiens. L’ADN de Neandertal détectable chez les Africains se trouve chez les Africains qui portent l’haplogroupe R1b.

Homo neanderthalensis mâle et femelle au Musée de Neandertal, Mettmann, Allemagne.

Homo neanderthalensis mâle et femelle au Musée de Neandertal, Mettmann, Allemagne. (UNiesert/Frank Vincentz/ CC BY SA 3.0 )

Haber pense que l’haplogroupe R1b a pénétré en Afrique centrale par le biais de deux migrations. La première migration, selon lui, a eu lieu il y a 6000 ans (6kya), et la seconde autour de 3kya. Le problème majeur de cette théorie est qu’il n’existe aucune preuve archéologique d’une migration de retour d’Eurasie vers l’Afrique.

La découverte d’un « mélange » eurasien chez les Africains n’est pas récente. Pickrell et al ont estimé que l’ascendance eurasienne des Africains de l’Est et du Sud de l’Afrique se situait entre 2,2 et 50 % et que les Mandé avaient un mélange eurasien de 2 %. Cela confirme l’affirmation initiale des auteurs de l’article de Mota – c’est-à-dire que l’affirmation selon laquelle jusqu’à 6-7% des ancêtres des groupes d’Afrique de l’Ouest et d’Afrique centrale étaient « eurasiens » n’était pas une erreur.

Il existe de nombreuses populations en Afrique de l’Est, du Sud et de l’Ouest qui sont porteuses d’un mélange eurasien. La fréquence la plus élevée de R1 se trouve en Eurasie occidentale. Cruciani et al affirment que la forme primitive de R1*M173 a été trouvée en Afrique. La fréquence du chromosome Y R1*-M173 en Afrique se situe entre 7 et 95 % et Coia et al disent que la moyenne de R1-M173 est de 39,5 % en Afrique. Les haplogroupes R sont caractérisés par le fond génétique R1-M207/M173. Les haplogroupes R eurasiens en Afrique comprennent : R1-M269, R-V88, R-L754 (R1b1a) et RL278 (R1b1).

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Recherches autosomiques pour le mélange génétique sur le continent eurasien (projet Dodecad).

Recherches autosomiques pour le mélange génétique sur le continent eurasien (projet Dodecad). ( CC PAR SA 4.0 )

Le chromosome Y V88 (R1b1a) a sa fréquence la plus élevée chez les locuteurs tchadiens, tandis que les porteurs du V88 chez les locuteurs nigéro-congolais (principalement les Bantous) se situent entre 2 et 66 % (Cruciani et al, 2010 ; Bernielle-Lee et al, 2009). L’haplogroupe V88 comprend les mutations M18, V35 et V7. Cruciani et al (2010) ont révélé que R-V88 est également porté par les Eurasiens – y compris les mutations distinctives M18, V35, et V7.

L’haplogroupe R1b1* se trouve en Afrique à différentes fréquences. Berniell-Lee et al (2009) ont constaté dans leur étude que 5,2 % des personnes étaient porteuses de Rb1* (RL278). La fréquence de R1b1* chez les Bantous varie entre 2 et 20 %. Les porteurs de R1b1* chez les populations pygmées se situaient entre 1 et 25 % (Berniell-Lee et al, 2009). La fréquence de RL278 chez les populations bissau-guinéennes était de 12 %. Les Toubou, Laal, et Sara ont des fréquences entre 20%-34% de RL754 (R1b1a).

Agriculteurs bantous près de Kismaayo en novembre 1993. ( Domaine public )

Outils de Néandertal

Les Néandertaliens utilisaient des outils moustériens. Ces outils étaient également utilisés en Afrique dès 130kya. Cela place les Néandertaliens en Afrique du Nord.

Les outils néandertaliens trouvés à Jebel Ighoud et Haua Fteah ressemblent aux outils néandertaliens européens contemporains. La présence d’outils moustériens suggère que les Néandertaliens se sont mélangés aux Africains car nous savons que des humains anatomiquement modernes vivaient dans la région à cette époque.

Le peuple nord-africain de Néandertal utilisait la trousse à outils commune levoiso-mousterienne découverte à l’origine en Europe. Selon Ki-Zerbo, les squelettes de Néandertaliens provenaient du Djebel Irhoud et d’El Guettar au Maroc. Plus tard, les Néandertaliens ont utilisé la boîte à outils Aterian. C’est probablement au Maroc que les Néandertaliens et les Khoisan ont interagi.

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Outils moustériens fabriqués par les Néandertaliens.

Outils moustériens fabriqués par les Néandertaliens. (Didier Descouens/ CC BY SA 4.0 )

Carleton S. Coon, dans The Living Races of Man (1965), Anthropology A to Z (1963) et The Races of Europe (1939), affirme que les Khoisan ont autrefois vécu en Afrique du Nord, des montagnes de l’Atlas jusqu’au Fezzan et au Sahel. Coon a également déclaré que les « Duwwud ressemblent aussi à des Hottentots. On trouve aussi au Sahara d’autres peuples en partie bushman et en partie négroïde ». Coon soutient que les Haritan comprennent également des éléments de l’ancienne population sud-africaine Khoisan (SAK).

Jusqu’à l’article Mota man de M. Gallego Llorente et l’article Haber, les chercheurs affirmaient que les Africains n’avaient aucune relation avec les Néandertaliens. Mais Prufer et al ont découvert que les Khoisan partagent plus d’allèles avec les Néandertaliens de l’Altaïque que les Denisova.

Représentation antérieure d'un homme de Néandertal.

Représentation antérieure d’un homme de Néandertal. ( paléolithique )

Haber a noté que l’ADN dérivé de tous les non-Africains est plus étroitement lié aux Néandertaliens du Caucase : Alraic Neanderthal(s).

Dans la section complémentaire des travaux de Prufer et al, la relation entre l’homme de Néandertal et le Khoisan est largement discutée. En ce qui concerne le Néandertal altaïque, les non-Africains ont un taux de divergence plus faible que les Africains – entre 10 et 20 %. Prufer et al (2013) notent peu de différence statistique entre la divergence non africaine et africaine.

Une conclusion intéressante de Prufer et al (2013) est que l’on estime que le Néanderthal altaïque et la Denisova ont des temps de partage similaires. Cependant, les estimations de divergence pour les Africains Khoisan-Mandekan et Altaïques sont plus jeunes que la division entre les Africains et les Denisova : des individus archaïques et des individus africains modernes. Les temps de partage entre le Khoisan et le Mandekan peuvent s’expliquer par la présence de l’haplotype AF-24 en Afrique de l’Ouest.

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Khoisan s'est engagé à faire rôtir des sauterelles sur des grilles. 1805. Aquatinte par Samuel Daniell.

Khoisan s’est engagé à faire rôtir des sauterelles sur des grilles. 1805. Aquatinte par Samuel Daniell. ( Domaine public )

Prufer et al (2013) ont détecté une relation entre les Néandertaliens et les Mandékans. Cela n’est pas surprenant maintenant que nous savons que les Mandekans ont 2% d’ascendance eurasienne, selon Pickerell et al.

En résumé, les diverses populations africaines ont des ancêtres eurasiens. Par conséquent, les chercheurs trouveront probablement plus d’Africains d’ascendance néandertalienne à l’avenir.

Image du haut : Reconstitution de ce à quoi pouvait ressembler un homme de Néandertal au Museum für Naturkunde, Berlin, Allemagne. Source : כ.אלון/ CC BY SA 3.0

Par Clyde Winters

Références :

CoiaV, G Destro-Bisol, F Verginelli, C Battaggia, I Boschi, F Cruciani, G Spedini, D Comas et F Calafell, 2005. Brève communication : mtDNA variation in North Cameroon : lack of Asian lineages and implications for back migration from Asia to sub-Saharan Africa, American Journal Physical Anthropology. http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/fulltext/110495269/PDFSTAR

Ki-Zerbo,J. (1981). Histoire générale de l’Afrique, Unesco, vol. 1 : Méthodologie et préhistoire africaine (1981), p. 572.

Joseph K. Pickrell, Nick Patterson, Po-Ru Loh, Mark Lipson, Bonnie Berger, Mark Stoneking, Brigitte Pakendorf et David Reich. (2014). Ancienne ascendance eurasienne occidentale en Afrique australe et orientale. PNAS 2014 111 (7) 2632-2637.

M. Gallego Llorente , E. R. Jones, A. Eriksson, V. Siska, K. W. Arthur, J. W. Arthur, M. C. Curtis, J. T. Stock, M. Coltorti, P. Pieruccini, S. Stretton, F. Brock, T. Higham, Y. Park, M. Hofreiter, D. G. Bradley, J. Bhak, R. Pinhasi, A. Manica.Erratum pour le rapport « Ancient Ethiopian genome reveals extensive Eurasian admixture in Eastern Africa » (précédemment intitulé « Ancient Ethiopian genome reveals extensive Eurasian admixture throughout the African continent ») de Science. 2016 Feb 19;351(6275). pii : aaf3945. doi : 10.1126/science. aaf3945.

Kay Pruler, Racimo, F., Patterson,N et autres (2014). Les séquences complètes du génome de l’homme de Néandertal de l’Altaï, dans les montagnes. Nature, 505/7481 : 43-9. doi .10.1038/ Nature 12881.Epub.2013. 18 décembre.

Scozzari, R, Massaia,A, Trombatta,B. et al.(2014). Une ressource impartiale de nouveaux marqueurs SNP fournit une nouvelle chronologie pour le chromosome Y humain et révèle une structure phylogénétique profonde en Afrique. Genome Research, 6 janvier 2014, doi : 10.1101/gr./60785.113.

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